مستند «بابلیون» روایتی است از روزگار مسیحیان عراق، مسیحیانی که داعش با قصاوت تمام دمار از روزگارشان درآورده و به جرم نداشته، هر جنایتی علیه آنها روا می دارد.

در این فیلم با برخی مجاهدان مسیحی که علیه تکفیری‌ها در حال مبارزه هستند گفتگو شده است؛ مجاهدانی که بر اساس عقاید مذهبی‌شان، خود را برادر مسلمانان می‌دانند و به دین اسلام هم احترام می‌گذارند.